1）微型动物的指示作用
原生动物和后生动物出现的顺序：细菌－植物型鞭毛虫－肉足类－动物型鞭毛虫－游泳性纤毛虫、吸管虫－固着性纤毛虫－轮虫
原生动物和微型后生动物的演替判断水质和污水处理程度，还可以判断污泥培养成熟程度；
根据原生动物的种类判断活性污泥和处理水质的好坏；根据原生动物遇恶劣环境改变个体形态及其变化过程判断进水水质变化和运行中出现的问题。