医药原料行业为精细化工行业的分支行业，属于重污染行业，主要以水污染为主。根据国家环保总局统计，化学原料COD污染量排名前4位，2006年COD污染贡献率达到11.7%、经济贡献率仅为8.2%，化学原料（包含医药原料）是前4大污染行业，为国家污染控制重点行业之一。经济效率和污染规模不匹配。医药行业既是高风险、高投入、高技术、高回报的行业，也是环保治理节能减排任务繁重的行业。