1、水冷冷水机组与风冷冷水机组，各有其自身的特点，要根据不同的使用环境、空间、及所需机组的制冷量大小、和不同的城市地域等来进行综合考虑加以选择。
2、水冷冷水机组必须配冷却塔，对于开式冷却循环水系统，由于冷却水吸收热量后，与空气接触，CO2逸入空气中，水中溶解氧和浊度增加，造成冷却循环水系统有4大问题：腐蚀、结垢、菌藻滋生及污泥。如果不对水质进行处理将严重损坏制冷设备，大幅度降低热交换效率，造成能源的浪费。因此，对系统水进行缓蚀、阻垢、杀菌灭藻处理是十分重要的。
水冷冷水机组冷却系统一定要安装电子水处理仪，或强磁水处理仪，不然散热效率衰减太大，使用时间越长，系统的效果越差，每年的水处理成本高，效果不可能达到100%的除垢。冷却循环水水质是关键。对冷却循环水进行处理分为物理法和化学法两种。物理法主要采用：静电水处理仪，电子水处理器，内磁式水处理器进行处理。
3、水冷/风冷冷水机组都可以用在小系统上，大机组绝大部分都是水冷的。水冷初投资就主机而言,是比风冷的少一点.但加上冷却塔和机房\电子水处理仪等,也少不到什么地方去!再说就长年运行来说,水冷机组的制冷效率相对会下降，风冷不会。
4、风冷冷水机组采用空气冷却方式，省去了冷却水系统所必不可少的冷却塔、冷却水泵和管道系统，避免水质过差地区造成冷凝器结垢、水管堵塞，还节约了水资源，是目前冷水空调设备产品中，保养维修最经济、简单的机种。风冷冷水机组比水冷冷水机组一次性投资要稍高，但是全年运转费用要低于水冷式冷水机组，机房建筑费用在各种空调冷热源系统中为最少，维修保养费用约为水冷式或锅炉的一半费用。风冷冷水机组的噪音和体积较水冷的大，只能安装在室外。水冷机组大多安装在地下室内。