南锚碇基础尺寸为70.5m×52.5m×29m（长×宽×深），为特大型嵌岩深基坑工程。设计方案经过初步设计阶段、技术设计阶段和带案招标设计阶段等对沉井、地下连续墙、冻结、地下连续墙加冻结、排桩加冻结基础方案的反复论证和比较，最终确定在国内首次采用 “冻结排桩基坑围护设计方案”。
水文条件南锚碇场区地下水位为+1.8～+2.2m，由于区域断裂构造的叠加影响及长江漫滩冲刷沉积，赋存两大含水层组——第四系孔隙微承压含水层组及基岩裂隙微承压含水层组，其渗透系数分别为2.0m/d和0.006～0.4 m/d，两个含水层与长江水系均有不同程度的水力联系。