根据设计图纸，矮岗站土建工程的基坑分成两个部分，车站主体结构（YDK-25-677.300～YDK-25-865.600）和站后折返线部分（YDK-25-865.600～YDK-26-160.100）。
车站主体结构支护工程采用钻孔桩结合内支撑支护组合结构体系，基坑安全等级二级，钻孔桩直径φ800，钻孔桩嵌固深度6.5(5.5)m。桩间采用φ550的双重旋喷桩止水。