生态修复工程分为三个部分，分别为排口治理工程、海绵城市建设工程、排口生态化处理工程。其中：排口治理工程主要针对排入翡翠湖的E01、E02、E04、E05、E06、E07、E08、E09、E10、E12等10个现状雨水排口，通过近自然的、可持续的措施，净化处理入湖雨水。排口治理工程共分为五册，包括排水工程、结构工程、电气工程、通风工程和建筑工程。其中，排水工程划分为两个分册，即调蓄池及管道工程、生态滤池及湿地工程。