隧道穿越地层地质条件复杂，全隧为可溶岩，构造活跃，洞身暗挖段发育有2条断层，根据隧道地质资料反映的情况看，本隧道存在的地质安全风险主要为：危岩落石、塌方、突水突泥、洞口失稳等风险。由于隧道洞身段为可溶性灰岩，突水突泥风险在隧道全程均布，在F13逆断层、F14断层，以及地表溶蚀洼地，落水洞发育段尤为突出；塌方地段主要集中在隧道通过断层及破碎带等地质构造带以及地表发育有岩溶漏斗、洞身浅埋段落；隧道进口边坡陡峻；坡面分布有危岩落石，可能发生落石的风险。总体来说，那吉隧道为高风险隧道，施工中采取合理措施降低风险。