采用“防、排、堵、截结合，因地制宜，综合治理”的原则；对于隧道穿过断裂破碎带段，预计地下水较大，当采用以排为主可能影响生态环境时，根据实际情况采用“以堵为主，限量排放”的原则，达到堵水有效、防水可靠、经济合理的目的。
隧道防水应重视初期支护防水，以衬砌结构自防水为主体，以施工缝、变形缝防水为重点，辅以注浆防水和防水层加强防水。
当地下水对混凝土结构具有侵蚀性时，应采取相应措施，保证结构的安全和耐久性
隧道K1+237-K1+304段处于浅埋层段，地表分布较薄的粉质粘土夹碎石层，其下为中-微风化石英砂岩夹泥层；长山隧道左线隧道洞身K3+100-K3+125段及右线K3+165-K3+195段均位于溶洞中，围岩级别为VI级，溶洞充填不均，结构稳定性差，整体性差，围岩极易坍塌变形；隧道的其余地段地基稳定，地势较平坦，排水条件良好，地质较简单。
