隧道防排水，采用“防、截、排、堵相结合，因地制宜，综合治理”的原则，争取隧道建成后达到洞内基本干燥的要求。隧道防排水设计对地表水，地下水进行妥善处理，形成一个完善通畅的防排水系统。
隧道结构防水一般由喷射混凝土、全封闭柔性卷材防水层和二次衬砌结构自防水等组成。鸡冠岭隧道第一道防水措施：在初期支护与二次衬砌之间敷设一层1.5mm厚单面自粘式ECB复合防水板与无纺布，本线隧道防水板与无纺布粘结在一起，从边墙下部的纵向引水管处至拱顶部连续施作，全隧道铺满；第二道防水措施：二次衬砌混凝土采用防水混凝土，其抗渗等级不低于S6。环向施工缝，在围岩衬砌类型变化处设置中埋式止水带止水，其他环向施工缝设置带注浆管橡胶膨胀止水条止水。
拱墙：在初期支护段渗水较集中处，铺设φ50弹簧排水管,10米/道，裂隙水发育处调整间距；两侧边墙外侧设纵向贯通的φ110HDPE打孔波纹管，该排水管通过三通接头与环向排水管及横向排水管连通；横向排水管在无仰拱段采用φ110HDPE打孔波纹管，有仰拱段设置不打孔波纹管。这样，通过以上措施，隧道衬砌外水经无纺布和环向排水管，由衬砌背后边墙底的纵向排水管汇集，最后通过横向排水管排入中心水沟，由中心水沟排至洞外。