石基互通式立交位于番禺市石基镇永善村以南1.1公里处，区域内地势低平，河沟纵横，村庄、人口较为密集，路网发达，软土广泛分布。
互通内京珠高速公路呈北南走向，清河大道呈东西走向，两路基本正交。清和大道是番禺市至莲花山港口的城市主干道，交通量较大，互通采用双喇叭型式。本标段范围为K17+900～K19+700，全长1800m；被交道清河大道起讫桩号为PK0+160～PK1+000，全长840m；互通内共设匝道9条，全长4257.053m；桥梁8座，总长1746.115m；涵洞7道；通道4处。