车站总长174.65米（外包长度），总宽18.7米，埋深2.85米。考虑车辆限界及建筑设计要求，车站主体结构标准段采用单柱双跨箱式框架结构，出入口采用箱式结构。均采用明挖顺做法施工。主体围护结构采用钻孔咬合桩加钢支撑，出入口采用Ф850SMWI法围护，车站西侧区间采用盾构法施工（为调头井），车站东侧区间采用盾构法施工（为始发井和到达井）。红普路站～九堡站盾构区间全长1052.648m，九堡站～九堡东站盾构区间全长962.515m
施工范围：九堡车站中心里程为k27+125.561，分界里程为k27+054.961和k27+229.611.城站站～湖滨站盾构区间右线设计起点里程为K26+003.113、左线设计起点里程为K26+039.180，设计终点里程为K27+055.761。红普路站～九堡站～九堡东站盾构区间设计起点里程为K27+228.811、右线设计终点里程为K28+191.326，左线设计终点里程为K28+206.691。