铁路全线地势由西北向东南倾斜。省界～广南，线路走行于云贵高原与广西盆地间的斜坡地带，即两大地貌单元的过渡区，沿线地形起伏剧烈，属于典型的山岭重丘区。广南～昆明，线路基本走行云贵高原面，高原地貌由低中山、丘陵和高原盆地及溶原组成。线路穿越我国两大流域，珠江流域西江水系与长江流域金沙江水系。
　　　沿线经过自然保护区、文物遗址、水源保护区、风景名胜区、野生动植物保护区等环境敏感区多处。
　　　根据以上特点，施工中应高度重视保护当地水资源和现有植被，最大限度的减少对当地环境的破坏。