施工沿线均处在荒漠戈壁中，北面天山融雪形成的大大小小的季节性河流、溪流在荒漠中随处可见。
　　　涵洞施工本着“尽早开工、尽早完工、以利后序”的原则组织施工。根据地质情况，部分涵洞圬工采用抗侵蚀性混凝土。
　　　基础开挖前需作好基础周围的临时排水设施，临时排水设施应与永久排水设施相结合；水中基础开挖采用围堰筑岛；基础采用挖掘机开挖，人工修整基坑，石方基础需爆破时采用风动凿岩机打眼小炮爆破。