1、水中施工，施工难度较陆地大，工序周期长，机械利用率低，而本工程要求工期紧，且征地拆迁、河道审批、交通影响等施工条件不充分。相应对策：必须配备足够的水中施工设备，采用蚂蚁啃骨头的策略，逐步展开工作面，加强工序衔接，水中平台、栈桥一次投入使用，钢模.钻机等设备按计算周期有效利用，暑期施工，施工效率降低，需要加大人力投入，采用加班作业，争取工期。
2、汛期施工，安全度讯意义重大，工程主要施工时间6~9月份为汛期，
对工程施工影响大。必须提前做好防汛准备工作，第一，水中工作平台标高控制在10米，避免洪水水位上涨，造成水中作业停止；第二，和上游节制闸、排水泵站管理部门取得联系，在放水前做好断电、排障等工作，做到防汛安全；钢护筒、钢管桩应插入硬质粘土层内，使平台具有良好的稳定性，具有抗洪水冲击的能力。
3 、水中施工作业难度大，河道内淤泥较厚，而桩基深达30~50米，施工时间长，易于塌孔，而河床标高航道部位要求在0.6米以下，承台沉箱内深度（水面以下）达13米。必须调整钻机作业参数，选用优质泥浆，采取各种措施缩短工序延迟时间，确保成孔质量；施工承台时，增加围堰抗滑桩以加强内撑强度，确保安全。
4、城东干道交通量大，桥头南、北侧两个路口（秦虹路、长乐路）交通繁忙，对工程施工影响很大，为使工程顺利进行，清除施工与交通间相互干扰，保障交通顺畅，须制定良好的交通疏解方案。经认真勘察现场，审核设计资料，认为需要封闭秦虹路口（可保留禄口机场至市内流向的左转方向），秦虹桥上为双向六车道，靠近长乐路口的80米为双向八车道，东侧设置往节制闸方向的右转车辆（前往秦虹路的车辆可从节制闸通过）。施工中需交管部门的大力配合，确保交通安全和施工顺利进行，
5、秦虹路口地下管线复杂，施工进度计划应与管线拆迁进度配合。据初步了解，与城东干道主桥交接墩B1、F1处为自来水管，F匝道施工将受秦虹桥侧Φ800自来水管影响，需制定详尽的管线配合计划以确保工程顺利进行。
6、桥梁位于城东干道两侧，而城东干道是南京市与禄口机场连接通道，是南京市的形象窗口，因此在施工中处处要贯彻安全、文明、环保，加强工程外观质量管理，争创文明工地。