茶亭站为地下两层岛式结构，总建筑9679.17㎡，总长163.3m，宽18.9～36.7m，车站净高13.55m，车站底板埋深约16.5m。车站主体基坑采用600mm地下连续墙围护及φ609钢支撑。
车站围护结构选用600mm的地下连续墙，墙体深度均为32m。车站主体围护结构地下连续墙标准槽段幅宽6m,共74幅，其中“一”字型58幅，“L”字型16幅，“，计 416.95延米。
根据岩土工程勘察报告，茶亭站场地地貌单元属秦淮河漫滩，场地范围分布的地层主要为第四系土层，上部主要由淤泥质粉质粘土组成，下部由淤泥质粉质粘土、粉土或粉细砂组成，场地地下水类型属孔隙潜水；深部砂性土层中地下水具微呈压性。
