办公区采用风机盘管系统，新风等二装时设置新风换气机，P2试验室及二层净化区均采用风冷冷风型净化空调器，机组自带完善的温湿度控制。
四层和六层的局部办公区，考虑到经常加班，单独设置VRV系统。中央空调系统冷热源选用2台高效节能的污水源热泵机组，水源为该建筑附件的XX湖的湖水。