肃州区地处欧亚大陆腹地，属典型大陆性气候，冬季受西北部冷高压的控制，冬季严寒，丰乐河封冻约在90天以上。该区夏季酷热，雨量稀少，蒸发强烈，冬季严寒,干旱多风沙。灌区日照时间长，积温高，干热风是主要灾害性天气。根据酒泉站地面基本气候资料统计，极端最高气温38.4℃，极端最低气温－31.6℃。多年平均降雨量85.3㎜，年蒸发量2148.8㎜，蒸发量是降雨量的25倍，最大风速25.7m/s。