柯柯亚二库工程位于鄯善县中部柯柯亚河流上，距上游柯柯亚水库12.0km，距鄯善县城30km，是柯柯亚河流上的二级水库枢纽工程，地理位置东经90°11′15″，北纬43°04′56″，是一座小（一）型拦河式水库。柯柯亚二库具有工业供水、城镇供水、农业灌溉等综合效益，是一项综合利用水利工程。柯柯亚二库总库容945.0万m3，最大坝高27.1m，与柯柯亚水库联合承担下游15.58万亩的农业灌溉和每年2712.6万m3的工业及城镇供水任务。