复杂高层建筑结构的抗震理论与应用主要包括以下内容：

结构设计：根据地震烈度和建筑物所处位置的地质条件等因素，采用适当的设计参数和结构形式，进行结构计算和设计，确保建筑物在地震时具有足够的抗震能力。

抗震措施：对于高层建筑结构，为了加强其抗震能力，通常会采取一系列的抗震措施，如加强梁柱节点、加装抗震支撑等。

基础设计：高层建筑结构的基础是其抗震能力的基础。在设计基础时，需要考虑地震作用对基础的影响，采用合适的基础类型和基础尺寸，确保建筑物的抗震性能。

构造材料：在高层建筑结构中，构造材料对其抗震性能的影响非常大。通常采用高强度钢筋混凝土、钢结构等材料，确保建筑物在地震时的稳定性和安全性。

抗震监测：在建筑物使用过程中，需要对其进行抗震性能监测，及时发现并处理可能存在的安全隐患，确保建筑物始终保持足够的抗震能力。