通过制定隧道安全专项施工方案以应对瓦斯、煤层、采空区、岩堆、大变形、环境侵蚀、浅埋泥灰岩地段出现塌方的出现，及时调整施工工艺工法，确保奉节隧道施工安全与质量，防止重大安全事故发生。隧道全段除明洞段采用明挖法施工，设置整体式明洞衬砌外，其余段落均采用暗挖法施工，设置复合式衬砌。隧道防水板采取阻燃的防水板，土工布采取阻燃的土工布。